Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20873J3QMQ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms