Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34c3J3QJW5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34c3J3QJW5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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