Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20828J3KMI7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms