Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20708H3BKF4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20708H3BKF4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms