Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pabpc4lG5E8X2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc4lG5E8X2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms