Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r58G3X9U3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r58G3X9U3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms