Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3tc1G3X9F6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3tc1G3X9F6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms