Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim55G3X8Y1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim55G3X8Y1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim55G3X8Y1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim55G3X8Y1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim55G3X8Y1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim55G3X8Y1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim55G3X8Y1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms