Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim15G3UY57 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim15G3UY57 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms