Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r39G3UWE6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r39G3UWE6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms