Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp72F8VQC1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp72F8VQC1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms