Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp9yF8VPU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp9yF8VPU6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms