Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngap1F6SEU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngap1F6SEU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms