Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm340F6RGI3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm340F6RGI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms