Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms