Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pik3c2bE9QAN8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pik3c2bE9QAN8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms