Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc146E9Q9F7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc146E9Q9F7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms