Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r35E9Q7U8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms