Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cdhr2E9Q7P9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdhr2E9Q7P9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms