Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Urb2E9Q7L1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Urb2E9Q7L1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms