Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DspE9Q557 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DspE9Q557 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DspE9Q557 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms