Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ApobE9Q414 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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