Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pi4kaE9Q3L2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pi4kaE9Q3L2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms