Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r238E9Q373 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r238E9Q373 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms