Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcc4E9Q236 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcc4E9Q236 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms