Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc171E9Q1U1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc171E9Q1U1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms