Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf2bp2E9Q1P8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms