Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt78E9Q0F0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt78E9Q0F0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms