Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm9972E9Q053 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm9972E9Q053 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms