Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx60E9PZQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ddx60E9PZQ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms