Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Scaf11E9PZM7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scaf11E9PZM7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Scaf11E9PZM7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms