Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dchs1E9PVD3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dchs1E9PVD3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms