Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcn1E9PVA8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcn1E9PVA8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms