Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgaE9PV24 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgaE9PV24 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms