Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU019823E9PUQ3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AU019823E9PUQ3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms