Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Syde2E9PUP1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syde2E9PUP1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms