Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Piezo1E2JF22 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Piezo1E2JF22 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms