Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930455H04RikD3Z622 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930455H04RikD3Z622 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms