Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms