Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms