Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf217D3YYI7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf217D3YYI7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf217D3YYI7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf217D3YYI7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf217D3YYI7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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