Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc170D3YXL0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc170D3YXL0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms