Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9230113P08RikD3YWX3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms