Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ptprz1B9EKR1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptprz1B9EKR1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ptprz1B9EKR1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Ptprz1B9EKR1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptprz1B9EKR1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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