Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nxpe3B9EKK6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nxpe3B9EKK6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms