Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmf1B9EKI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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