Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cttnbp2B9EJA2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms