Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clip3B9EHT4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clip3B9EHT4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms