Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms