Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp26c1B2RXA7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp26c1B2RXA7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms